本项目在保持日常运行的基础上根据外部实际环境的变化完善培养方案，以适应时代变化对公共部门行政的挑战，与时俱进地为公共部门培养人才。因此管治结构需兼顾垂直命令和水平指导，即具有纵向垂直的日常管理机构，也具有负责持续完善培养方案的横向水平专业性教学指导机构。

一方面，从院务会到MPA教育中心的垂直管治链条清晰，院长及其领导的院务会主要在重大事项上起决策和监督作用，MPA教育中心对自己日常管理工作具有很强的自主性。另一方面，设立MPA教学指导委员会负责评估学生五项能力的培养情况，常态化提供教学培养和项目日常运行的意见和建议。

目前MPA教育中心有全职工作人员5人，主任1人，招生主管1人、教学主管2人（北京校区、珠海校区各1人），学生事务和财务主管1人 ，能够满足项目正常运转的需要。